Minulla on USA: n Midwestin rasterikartta, joka on hyvin harva, eli mielenkiintoiset pikselit ovat tarpeeksi pieniä melkein näkymättömiin, kun niitä tarkastellaan asteikolla, jossa kaikki Yhdysvaltain keskilännen osavaltiot ovat näkyvissä. Haluaisin noudattaa tässä PNAS-paperissa esitettyä lähestymistapaa luoda parempaa karttaa, mutta ei ole varmaa, miten kopioida se ArcGIS: ssä Mikä tahansa apu olisi tervetullutta. PNAS-paperissa esitetään vaiheet seuraavalla tavalla. Koska vaihtelualueiden pienet koot ja hajallaan oleva jakautuminen oli vaikeaa, LCLUC alkuperäisellä 56-m: n spatiaalisella resoluutiolla Tuloksena käytimme aluesuunnittelustekniikoita alueellisen muutospinnan luomiseksi, joka korosti paikallisia muutoksenhankkeita. Lähentymistapoja käytetään esimerkiksi aluepidemiologian aloilla, jotta saatiin vakaa estimaatti sairausnopeuksista 48, mutta ne ovat ei ole laajasti sovellettu maanmuutostutkimuksen alalla Tasoitusmallimme muuttamalla pikselit 56 m: n spatiaalisella resoluutiolla koottiin ensin muutoksen prosenttiosuudeksi 560-m: n resoluutio Tämä tapahtui ottamalla 10 x 10 lohkoa 56 m pikseliä eli 100 pikselin lohkoa ja summalla binaarimuutos jokaisessa lohkossa. Kuva S4A Seuraavaksi käytimme 2D-ytimen pehmeämpää laskea tasoitettu prosenttiosuuden estimointi kullekin lohkolle 560 m: n tarkkuuskuvakkeet Kuva S4B Kvarttisen ytimen funktiota käytettiin laskeamaan liikkuvia keskiarvoja tutkimusalueen yli 10 km: n kaistanleveydellä. Sama kvartsirunkofunktiota käytettiin tasaamaan prosentuaalinen muutos maissi-soijasta vuonna 2006 nurmioksi vuonna 2011. Lopuksi me syntyi tasoitettu nurmikoiden kartta vuonna 2006 yhdistämällä nurmialueiden läsnäolo 56 m: n tarkkuudella 560 metrin tarkkuudella nurmikkoa varten, ja tasoittamalla tämä yhteenlaskettu päällystekerros käyttämällä samaa 10 km: n kvartsirumua. Tämä tasoitettu nurmikon peitekerros oli jota käytetään myöhemmin nimittäjänä nurmikon muuntamisen suhteellisen määrän kartan luomisessa. Koska ymmärrän, tämä on vuokaavio 1 Käytä lohkotilastoja ArcGIS: ssä summaan 10x10 pikseliä 56 m rasterista 560m rasteri 2 2D ydin pehmeämpi ole varma, miten tämä 3 Quartic ydin ei ole varma, miten tämä tehdään. Ei varma, miten edetä vaiheessa 1. asettui 15 elokuu 14 klo 0 29.Base R sisältää monia toimintoja, joita voidaan käyttää lukemiseen , visualisointi ja paikkatietojen analysointi Tässä näkökulmassa keskitytään maantieteellisiin paikkatietoihin, joissa havainnot voidaan tunnistaa maantieteellisillä paikoilla ja joissa voidaan hakea lisätietoa näistä sijainneista, jos sijainti kirjataan huolellisesti. Base R - toimintoja täydentää joista osa on CRAN: ssa ja muut ovat vielä kehittymässä Yksi aktiivinen sijainti on R-Forge, joka esittelee spatiaalitietojen ja tilastoprojekteja projektipuussaan. Tietoja R-spatialpaketeista, erityisesti sp on lähetetty R-Forge rspatial - projektin verkkosivusto, johon sisältyy visualisointikartto Sp-aktiivinen kehittäminen jatkuu Githubilla. Contributed-paketit käsittelevät kahta laajamittaista aluetta, jotka siirtävät paikkatietoja R: ään ja ulos ja analysoivat alueellisia tietoja R: ssä. R-SIG-Geo - postilista on hyvä paikka aloittaa avun saamiseksi ja kysymysten käsittelemisestä sekä tietojen saantiin että analysointiin. Postituslista on hyvä paikka etsiä tietoja kyseisistä kursseista. kursseja löytyy tämän blogin Tapahtumat-välilehdeltä. Oppimateriaaleja ja esittelyjä on useita, joista viimeisin on esittely Robin Lovelacen ja James Cheshiren spatiaalisten tietojen visualisoinnista R: ssä. Tätä näkemystä voidaan karkeasti jäsentää seuraavat asiat Jos olet sitä mieltä, että jokin paketti puuttuu luettelosta, ilmoita siitä. Paikkatietojen luokitukset Koska monet paikkatietoa tuovat ja käyttävät paketit ovat joutuneet sisällyttämään esineitä tietojen ja toimintojen tallentamiseen sen visualisoimiseksi, on käynnissä yhteisten luokkien ja paikkatietojen piirtotoimintojen muodostaminen Sp-pakettia käsitellään R-uutiskirjeessä Uusi paketti nimeltä sf on nyt CRAN-järjestelmässä ja sitä käytetään aktiivisesti kehitetty GitHub tarjoaa yksinkertaisia ominaisuuksia R Pakkauksen kehittämiseen tukee R-konsortio Se tarjoaa yksinkertaisia ominaisuuksia pääsyn vektoritietojen, ja sellaisenaan on nykyaikainen toteuttaminen sp osia monia muita paketteja on tullut riippuvainen sp luokat, mukaan lukien rgdal ja maptools rgeos-paketti tarjoaa käyttöliittymän topologiatoiminnoille sp-objekteille käyttäen GEOSia stplanr tarjoaa spatialLinesNetwork-luokan, joka perustuu objekteihin, jotka on määritelty sp: n ja igraph: in, joita voidaan käyttää reitityksen analyysiin R Toinen verkkopaketti on shp2graph The cleangeo voidaan käyttää paikkatietokohtien tarkastamiseen, helpottaa topologisten virheiden käsittelyä ja raportointia sekä geometrian pätevyysongelmia. Se väittää tarjoavan geometrian puhtaamman, joka korjaa kaikki geometrian ongelmat ja poistaa ainakin vähentää todennäköisyyttä, että ongelmia esiintyy tilatietojen käsittelyssä. Rasteri paketti on paikkatietoluokkien merkittävä laajennus virtualisoimaan suurien rasterien pääsyä , joka mahdollistaa suurien objektien analysoinnin ja laajentaa analyyttiset työkalut sekä rasteri - että vektoritietoihin Käytettynä rasterVis: n kanssa se voi myös parantaa visualisointia ja vuorovaikutusta Paketti sisältää spatiaalisia toimintoja, jotka on tarkoitettu parantamaan rasteripaketin ydintoimintoja, prosessointimoottori käytettäväksi rasterien kanssa Micromap-paketti tuottaa linkitettyjä mikromapsia ggplot2: n avulla. recmap-paketti sisältää suorakaiteen muotoisia kartografioita, joiden suorakaiteen koko on esimerkiksi väestö, jossa tilat ovat yksinkertaisempi binning-lähestymistapa Yhdysvaltojen osavaltioihin. spacetime-paketti laajentaa sp - ajastustiedot katso Spati-Temporal Data in R Grid2Polygons muuntaa spatiaalisen objektin luokasta SpatialGridDataFrame SpatialPolygonsDataFrame. An vaihtoehtoinen lähestymistapa joitakin näistä kysymyksistä on toteutettu PBSmapping paketti PBSmodelling tarjoaa mallinnus tukea Lisäksi GEOmap tarjoaa kartoitus tilat t o täyttävät geologien tarpeet ja käyttävät geomapdata-pakettia. Handlingin paikkatiedot Useita paketteja on kirjoitettu käyttäen sp-ryhmiä Rasteripaketti esittelee monia GIS-menetelmiä, jotka nyt mahdollistavat paljon paikkatietojen tekemistä tarvitsematta käyttää GIS: ia R: lle voidaan täydentää gdistance, joka tuottaa etäisyyksien ja reittien laskemisen maantieteellisillä ristikoilla geosfääri mahdollistaa maantieteellisten koordinaattien maantieteellisten tietojen maantieteellisten etäisyyksien ja alueen laskennan DggridR-paketti tarjoaa käyttöliittymän DGGRID: lle erillisten globaalien verkkojen, käyttäen kolmiota ja kolmiota ja timantteja ratkaisemaan ongelma, että jokaisella binolla on sama alue. Spsurvey-paketti tarjoaa valikoiman näytteenottotoimintoja. Laajennuspaketti laajentaa sp-luokkia, jotka mahdollistavat eläinten seurannan paikkatietojen käytön ja manipuloinnin. hdeco-paketti tarjoaa hierarkkisen entropian hajoaminen kategoristen karttojen vertailua varten GeoXp-paketti sallii vuorovaikutteisen g rafinen tutkiminen paikkatietojen analysointi Spcosa tarjoaa spatiaalisen peiton näytteenoton ja satunnaisotannan kompakteista maantieteellisistä kerroksista Magclass tarjoaa dataluokan parantamaan yhteentoimivuutta, joka toimii tilatietojen ja vastaavien funktioiden ja menetelmien muunnosten, peruslaskutoimitusten ja perustietojen manipuloinnin kanssa. spatiaaliset, temporaaliset ja muut ulottuvuudet helpottamaan kehitettyjen työkalujen kehittämistä ja yhteentoimivuutta Lisäominaisuuksia ovat nimien pohjainen tietojen käsittely ja sisäisen johdonmukaisuuden tarkastukset, esim. oikean datamäärän tarkistaminen laskelmissa. UScensus2000 pakettien paketti UScensus2000cdp UScensus2000tract tekee käytön 2000 Yhdysvaltain väestönlaskennasta saatavia tietoja helpompi Guerryn pakettiin sisältyvä tärkeä tietojoukko, Guerin s Moralin tilasto Ranskaan, joka tarjoaa tietoja ja karttoja sekä esimerkkejä, joiden tarkoituksena on edistää monimuuttujien ja tilastollisten analyysien integrointia. Marma p-paketti on suunniteltu lataamaan, piirittämään ja manipuloimaan batymetriaa ja topografista dataa R marmap voi kysyä NOAA: n isännöimän ETOPO1-batymetria - ja topografia-tietokannan, käyttää yksinkertaisia leveys - ja pituussuuntaisia tietoja ascii-muodossa ja hyödyntää edistyneitä piirustustyökaluja saatavana R: ssä julkaisun laadun rakentamiseksi julkaisuissa PLOS-paperi Nykyiset maarajoitukset toimitetaan 2 päätöslauselmassa rworldmap-toiminnolla sekä toiminnoilla, jotka liittyvät maantieteellisten nimien tai koodien mukaisiin taulukkotietoihin ja karttoihin. Kloroplet - ja kuparikarttoja tuetaan ja yleiset toiminnot toimivat käyttäjän toimittamat kartat Katso uusi R-paketti Global Data - datapohjan määrittämiseen Korkeammat resoluution maarajat ovat saatavissa linkitetystä paketista rworldxtra Historiallisia maavaltoja 1946-2012 voidaan hankkia cshapes-paketista sekä matkan matriisien laskentatoiminnoista. Katso Mapping and Measuring Country Shapes. Peruutuspaketti, johon on liitetty JSS-paperi, tarjoaa työkaluja hyödyntämiseen rengas ja kehittää kehitystyökaluja kauko-ajonantotietoihin taRifx on joukko hyödyllisyys - ja mukavuustoimintoja sekä mielenkiintoisia paikkatieto-ominaisuuksia gdalUtils-paketti tarjoaa kääreitä Geospatial Data Abstraction - kirjastoon GDAL Utilities. An rOpenSci-blogimerkintä kuvaa GeoJSON-keskittymistä lukemiseen GeoJSON ja WKT-tiedot GeoJSON voidaan kirjoittaa ja lukea rgdalilla ja WKT: llä rgeos-nimillä Geojson geojsonio geoaxe ja nurmikko muun muassa rgbif-paketin avulla voidaan käyttää Global Biodiversity Information Facility GBIF - tietoja Geoaxen avulla käyttäjät voivat jakaa geospatiaalisia esineitä palasiksi nurmipaketti on Turfjille geospatiaalisen analyysin asiakas. Paikkatietojen kirjoittaminen ja kirjoittaminen - rgdal Kartat voivat olla vektoripohjaisia tai rasteripohjaisia. rgdal-paketti tarjoaa sidoksia GDAL-tuettuihin rasterimuotoihin ja OGR-tukemat vektorimuodot. Se sisältää toiminnot, rasteritiedostot tuetuissa tiedostomuodoissa Paketti tarjoaa myös PROJ4-projektiotukea veille ctor-objektit Tällä sivustolla on saatavissa olevat proj 4 - projektien proj 4 - esitysprojektit Affin ja samankaltaisuuden muunnokset sp-objekteilla voidaan tehdä käyttämällä vec2dtransf-paketin toimintoja. Rgdalin Windows - ja Mac OSX CRAN - bändeillä on mahdollisia tietolähdeajureita, jos muita tarvitaan muut muuntaminen-apuohjelmat tai asennus lähteestä GDAL-versiota vastaan vaadittavilla ajureilla rgeos-paketti tarjoaa toimintoja WKT-geometrian tunnetun tekstin lukemiseen ja kirjoittamiseen ja wkb-paketti tarjoaa toimintoja tunnetun binäärisen WKB-geometrian lukemiseen ja kirjoittamiseen. Paikkatietojen lukeminen ja kirjoittaminen - muut paketit CRAN-karttojen vektoritietojen käyttämiseen on olemassa useita muita paketteja mapdatalla ja mapproj tarjoaa pääsyn samantyyppisiin maantieteellisiin tietokantoihin kuin S-RArcInfo mahdollistaa ArcInfo v 7 - binaaritiedostot ja e00-tiedostot lukea ja maptools ja shapefiles lukea ja kirjoittaa ArcGIS ArcView shapefileja NetCDF-tiedostoille, ncdf4 tai RNetCDF voi olla Käytetty maptools-paketti tarjoaa helper-toimintoja kartan monikulmitiedostojen lukemiseen, joita WinBUGS, Mondrian ja tmap-komento luetaan Stata: ssa. Se tarjoaa myös liitäntäfunktioiden PBSmapping - ja spatstat - ja sp-luokkien välillä karttojen tietokantojen ja sp-luokkien lisäksi. myös liityntä GSHHS rantaviiva tietokantoihin gmt paketti tarjoaa yksinkertaisen rajapinnan GMT kartta-ohjelmisto ja R geonames on käyttöliittymä palvelu OpenStreetMap antaa pääsyn avoimiin katukartta rasterikuvat ja osmar tarjoaa infrastruktuurin pääsy OpenStreetMap tiedot eri lähteistä , toimimaan yhteisten R-tietojen kanssa ja muuttamaan tietoja olemassa oleviin R-pakettien tarjoamaan käytettävissä olevaan infrastruktuuriin. rpostgis-paketti tarjoaa lisätoimintoja RPostgreSQL-pakettiin R-liittymälle ja PostGIS-tietokannalle sekä kätevät kääreet yhteiset PostgreSQL-kyselyt PostGIStools-paketti tarjoaa toiminnot muunnettaessa geometriaa ja tallentamalla tietotyyppejä PostgreSQL: stä tavallisiin R-kohteisiin sekä yksinkertaistamaan R-datakehysten tuontia, mukaan lukien paikkatietorekvenssit PostgreSQL: ksi. Integrointi versioon 6 ja johtava avoimen lähdekoodin GIS, GRASS, tarjotaan CRAN-paketissa spgrass6 käyttäen rgdal-dataa GRASS 7: lle käytetään rgrass7 RPyGeo on kääre Pythonin pääsyyn ArcGIS GeoProcessorille ja RSAGA on samanlainen kuoriopohjainen kääre SAGA-komennoille RQGIS-paketti luo rajapinnan R: n ja QGIS: n välillä eli se mahdollistaa käyttäjän pääsyn QGIS-toimintoihin R-konsolista Tämä saavutetaan käyttämällä QGIS Python - ohjelmaa komentorivillä Huomaa myös tämä säike vaihtoehtoisessa R QGIS - integroinnissa. Visualisointi Visualisointiin RColorBrewer-pakettiin sisältyvät väripaletit ovat erittäin hyödyllisiä ja niitä voidaan muokata tai laajentaa käyttäen R: llä varustettua colorRampPalette-funktiota ClassInt-paketti tarjoaa toimintoja luokkien väleinmäärien määrittämiseksi temaattiselle kartografialle Tmap-paketti osoittautui s nykyaikaisen perustan temaattiselle kartoitukselle valinnaisesti graafisen graafisen syntaksin avulla Koska sillä on oma verkko-grafiikkapiiri, se estää geometristen sovellusten vahvistamisen käytettäväksi ggplot2: n kanssa. Karttakuvapaketti tarjoaa tavat nähdä tilatiedostot interaktiivisesti, tavallisesti web-kartoitusalustalla Quickmapr-paketti tarjoaa yksinkertaisen tavan visualisoida sp - ja rasteriobjekteja, mahdollistaa paikkatietokohtien peruslatauksen, punnitsemisen, tunnistamisen ja merkitsemisen eikä vaadi tietojen maantieteellisiä koordinaatteja. Kartografiapaketti mahdollistaa erilaisten kartografisten esitysten, kuten suhteellisen symbolit, choropleth, typologia, virrat tai epäjatkuvuudet Mapmisc-paketti on minimaalinen, kevyt työkalu työkalujen tuottamiseen R: n kaltaisilla karttoilla, joilla tuetaan karttaa Käyttäjä haluaa sijoittaa kartan taustan muiden näyttöjen taakse, RgoogleMaps-paketti Google Maps TM: n käyttö voi olla hyödyllistä ggmap voidaan käyttää spatiaaliseen visualisointiin Google Mapsin ja OpenStren avulla etMap ggsn tarjoaa pohjoiset nuolet ja asteikot tällaisille karttoille plotGoogleMaps-paketti tarjoaa menetelmiä spatiaalisten ja tilapäisten objektien visualisointiin Google Mapsissa selaimessa plotKML on paketti, joka tarjoaa menetelmiä spatiaalisten ja tilapäisten objektien visualisointiin Googlessa Maapallon toinen vaihtoehto on lehtinenR, joka tarjoaa perustiedot web-kartoitus toiminnallisuuden yhdistää vektoritiedostoja ja verkkokarttojen laatat eri lähteistä. Pistekuvion analyysi Spatiaalipaketti on suositeltava paketti, joka on varustettu perusrulla R ja sisältää useita ydintoimintoja, mukaan lukien toteutus Khatin kirjoittaja Prof Ripley Lisäksi spatstat sallii vapauden määritellä kiinnostuksen kohteena olevaa aluetta ja tekee laajennuksia merkittäviin prosesseihin ja tilakovariateihin. Sen vahvuudet ovat mallin sovitus ja simulointi, ja sillä on hyödyllinen kotisivu. Se on ainoa, paketti, jonka avulla käyttäjä voi sovi epähomogeenisiin pisteprosessimalleihin interpoint-vuorovaikutuksilla paketti sisältää kaaviot, graafisen visualisoinnin ja kaaviopohjaiset yhteenvedot, joita käytetään spatiaalisen pistekuvion analyysiin Splancs-paketti mahdollistaa myös pisteiden tietojen analysoinnin kiinnostavan monikulmion alueella ja kattaa monet menetelmät, mukaan lukien 2D-ytimen tiheydet Smacpod-paketti tarjoaa erilaisia tilastollisia menetelmät tapauskonttitietojen analysointiin Käytetyt menetelmät ovat seuraavat Wallerin ja Gotwayn kansanterveystilastojen sovelletun tilastollisen tilaston luvussa 6 esitetyistä menetelmistä. Tarjolla on spatiaalikuvioissa käytettäviä spatiaalikuvioanalyysejä koskevia kääreitä, toimintoja ja tietoja ECESPA AEET - ympäristön ekologisuus Myös tuhkan ruudukkipisteiden toiminnot voivat olla kiinnostavia Mainospaketti suorittaa Ripleyn K-funktiosta peräisin olevia ensimmäisen ja toisen kertaluvun monialaisia analyysejä. Aseta-paketti on kokoelma toimintoja, joilla arvioidaan tilastolliset tilastot ja laskennalliset geometriat spatiaalisista pisteistä spatialkernel tarjoaa reunakorjatun ytimen tiheyden estimointi ja binäärisen ytimen regressioarvio monivariateista spatiaalipisteen prosessidataa varten DSpat sisältää etäisyyden näytteenottotietojen spatiaalisen mallintamisen funktioita ja spatialegregaatio tarjoaa segregaatiotoimenpiteitä multitype-spatiaalisten pisteiden mallille GriegSmith käyttää Grieg-Smith-menetelmää 2-ulotteiseen spatiaalitietoon dbmss-paketti mahdollistaa yksinkertaisen tilojen tilastollisten funktioiden koko joukko, mukaan luettuna klassiset Ripley s K ja muut ja viimeisimmät, joita käytetään paikkatieteellisissä taloustieteilijöissä Duranton ja Overman s Kd, Marcon ja Puech s M Uskaltaa spatstatille ydinlaskennan ristille Density sisältää toimintoja, lasketaan Barryn ja McIntyren hilapohjainen tiheysestimaattori, joka laskee pisteprosessit kahteen osaan, joilla on epäsäännölliset rajat ja reiät. Geostatiikka GSTAT-paketti tarjoaa laajan valikoiman toimintoja univariate - ja monimuuttujien geostatiikalle myös suuremmille datasetille. geoR ja geoRglm sisältävät f modaalipohjaisten geostatiatioiden tekeminen Variogramin diagnostiikka voidaan suorittaa vardiagilla Automaattinen interpolointi käyttäen gstatia on saatavana automapissa Tämä pakettiperhe täydentyy intamap-menetelmällä automatisoidulla interpoloinnilla ja psgp: llä, joka toteuttaa projisoidun harvaan Gaussin prosessin krigointia Vastaavasti monenlaisia toimintoja on löytynyt kenttien paketti Spatiaalipaketti toimitetaan perusrulla R ja sisältää useita ydinfunktioita spBayes-paketti sopii Gaussin yksivariaatti - ja monimuuttujamalleihin, joissa on MCMC-ramppeja, on erilainen Bayesian geostatistinen mallinnuspaketti Geospt-paketti sisältää joitakin geostatistisia ja radiaalipohjaisia paketteja toimintoja, mukaan lukien ennustus ja risti validointi Lisäksi se sisältää toimintoja optimaalisten paikkatietojen näytteenottoverkkojen suunnitteluun geostatistisen mallinnuksen perusteella Geostatsp-paketti tarjoaa geostatistisia mallintamismahdollisuuksia Raster - ja SpatialPoints-objektien avulla. Ei-Gaussian-mallit sopivat INLA, ja Gaussin geostatistiset mallit käyttävät suurimman todennäköisyyden arviointia. RandomFields-paketti tarjoaa satunnaisten kenttien simulointiin ja analysointiin liittyviä funktioita, ja geograafin gstat ja tämän paketin välillä voidaan siirtää variogrammamallikuvauksia. SpatialExtremes ehdottaa useita lähestymistapoja spatiaalisten ääriliikkeiden mallinnukseen käyttäen RandomFields-ohjelmaa. Lisäksi CompRandFld constrainedKriging ja geospt tarjoavat vaihtoehtoisia lähestymistapoja geostatistiseen mallinnukseen SpTimer-paketti pystyy sovittamaan, spatiaalisesti ennustamaan ja ajallisesti ennakoimaan suuria määriä avaruudellisia tietoja käyttäen 1 Bayesian Gaussin prosessin GP - malleja, 2 Bayesian automaattista regressiivista AR-mallia ja 3 bayesilaista Gaussin ennustavaa Prosessit GPP-pohjaiset AR-moduulit rtop-paketti tarjoaa toiminnot geostatistisen interpoloinnin yhteydessä epäsäännöllisen avaruustukeen, kuten valumaintaan liittyvät tiedot tai tiedot hallinnollisista yksiköistä Georob-paketti tarjoaa toimintoja lineaaristen mallien sovittamiselle spatiaalisesti korreloituihin virheisiin robusti ja G aussian rajoitettu suurin todennäköisyys ja laskettaessa luotettavia ja tavanomaisia piste - ja lohko-kriging-ennusteita sekä hyödyllisyystoimintoja ristiinvalidointiin ja log-transformoidun datan kriging-ennusteiden puolueettomaan takaisinmuunnokseen SpatialTools-paketti korostaa krigingin ja tarjoaa toimintoja ennakointiin ja simulointiin ExceedanceTools laajentaa sitä, joka tarjoaa työkaluja luotaessa luotettavia alueita ylitysalueille ja ääriviivoja varten. Hammaspyöräpaketti toteuttaa yhteisiä geostatistisia menetelmiä puhtaalla, suoraviivaisella ja tehokkaalla tavalla ja sanotaan olevan SpatialToolsin lähes uudelleenkäynnistys. paketti toteuttaa spatiaalisen virheen arvioinnin ja permutaatiopohjaisen spatiaalisen muuttujan merkityksen käyttäen erilaisia spatiaalisia ristiintarkistuksia ja spatiaalisia lohkojen käynnistysmenetelmiä. Myös sgeostat-paketti on saatavana. Samassa yleisessä paikallisessa alueessa ovat deldir - ja tripack-paketit kolmiota ja akima-paketti splinille interpolati Lisäksi MBA-paketti sisältää hajanaisen datasisällön monitasoisten B-spline-rivien kanssa. Lisäksi on spatiaalinen varianssipaketti, joka tukee spatiaalisten kovarianssimatriisien laskemista suorakulmioille, regressiopaketin rakentaminen osittain spatiaaliseen varovaisuuteen ja tgp-paketti Stem-paketti mahdollistaa tilamittaisen mallin parametrien estimoinnin käyttäen EM-algoritmia ja parametrien standardivirheiden estimointi käyttäen spatia-ajallista parametrista bootstrap-kenttää FieldSim on toinen satunnaiskenttäsimulaatiopaketti SSN on geostatistisen mallinnuksen dataa streamissa verkot, mukaan lukien in-stream-matriisiin perustuvat mallit Mallit luodaan käyttäen liikkuvia keskimääriä rakenteita Spatiaaliset lineaariset mallit, mukaan lukien koverajat, sopivat ML - tai REML-kartoitukseen ja muita graafisia toimintoja sisältyy. IP-dw tarjoaa toimintoja o interpoloi georeferoitu pistetiedot Inverse Path Etäisyyden painotus Hyödyllistä rannikkokalustoa varten wh maisema-esteet estävät interpoloinnin euklidien etäisyyksien kanssa RSurvey voidaan käyttää spatiaalisesti hajotettujen tietojen käsittelyohjelmana ja pystyy virheenkorjauksiin ja tietojen visualisointiin. Disease mapping ja areal-data-analyysi DCluster on paketti tilastollisten klustereiden havaitsemiseen sairaudet Se ulottuu ja riippuu spdep - paketista, joka tarjoaa perustoimintoja naapurilistojen ja spatiaalipainojen rakentamiseen, spatiaalisen autokorrelaation testit alueellisiin tietoihin, kuten Moran s I, ja spatiaalisten regressiomallien kuten SAR - ja CAR-malleihin. Nämä mallit oletetaan, että spatiaalinen riippuvuus voidaan kuvata tunnetuilla painoilla SpatialEpi-paketti tarjoaa käyttöön klusterin havaitsemisen ja sairauden kartoitusfunktion, mukaan lukien Bayesin klusterin havaitsemisen, ja tukee rivejä. smerc-paketti tarjoaa tilastollisia menetelmiä datan aluetietojen analysoimiseksi, klusterin havaitseminen diseasemapping-paketti tarjoaa muodon populaatio ja tapaustutkimus, standardoidut incidence-arvot lasketaan ja BYM-mallin sovitus INLA: n avulla Monikulmio-esineiden alueellistaminen saa AMOEBA: n funktion spatiaalisten klustereiden laskemiseksi käyttämällä Getis-Ordin paikallista tilastotietoa. Se etsii epäsäännöllisiä klustereita ekotooppeja kartalla, ja skater in spdep Seg ja OasisR paketit tarjoavat toiminnot mittaamaan aluekohtaista segmentointia OasisR sisältää Monte Carlo simulaatiot indikaattoreiden testaamiseen Spgwr-paketti sisältää maantieteellisesti painotettujen regressiomenetelmien toteuttamisen mahdollisen ei-stationaktiivisuuden tutkimiseen Gwrr-paketti sopii maantieteellisesti painotettuun regressioon GWR malleja ja työkaluja GWR-mallien kolinearisuuden diagnosointiin ja korjaamiseen Sopii myös maantieteellisesti painotettuun harjanteiden regressioon GWRR ja maantieteellisesti painotettuihin lasso GWL - malleihin GWmodel-paketti sisältää toimintoja maantieteellisesti painotettujen mallien laskentaan Lectools-paketti tarjoaa tutkijoille ja kasvattajille helposti oppivan käyttäjän frie Näitä ovat paikalliset Pearson ja maantieteellisesti painotetut Pearson-korrelaatiokertoimet, Spatial Inequality Measures Gini, Spatial Gini, LQ, Focal LQ, Spatial Autocorrelation Global ja Paikallinen Moran s I, useita maantieteellisesti painotettuja regressiotekniikoita ja muita spatiaalianalyysityökaluja muihin maantieteellisesti painotettuihin tilastoihin Tämä paketti sisältää myös tehtäviä, joiden avulla mitataan kunkin tilastoluvun merkitys, joka perustuu pääasiassa Monte Carlo-simulointiin. Sparr-paketti tarjoaa toisen lähestymistavan suhteellisiin riskeihin. CARBayes paketti toteuttaa bayesilaisia hierarkkisia aluekohtaisia yksikkömalleja Tällaisissa malleissa spatiaalinen korrelaatio mallinnetaan joukolla satunnaisia efektejä, joille on annettu ehdollinen autoregressiivinen CAR: n etukäteisjakelu Esimerkkejä mukana olevista malleista ovat BYM-malli sekä äskettäin kehitetty paikallinen spatiaalinen sileä hing-malli GlmmBUGS-paketti on hyödyllinen tapa välittää tilamalleja WinBUGS: lle SpaMM-paketti sopii spatiaalisiin GLMM: ihin, käyttäen Matern-korrelaatiofunktiota avaruuden satunnaisten vaikutusten perusmallina PReMiuM-paketti on profiilin regressioon, joka on Dirichlet-prosessi Bayesian klusterointimallilla se tarjoaa spatiaalisen CAR-termin, joka voidaan sisällyttää kiinteisiin vaikutuksiin, jotka ovat globaaleja eli ei-klusterispesifisiä parametreja, jotta voidaan ottaa huomioon jäännöksissä oleva spatiaalinen korrelaatio. spacom-paketti tarjoaa työkaluja konstruoimaan ja hyödyntämään spatiaalisesti painotettuja kontekstitietoja ja mahdollistaa myös tuloksena olevan spatiaalipainotetun kontekstitietojen yhdistämisen yksittäisten tason ennustajien ja tulosmuuttujien kanssa monitasoisen mallinnuksen kannalta Geospacom-paketti tuottaa matemaattisia matriiseja muototiedostoista ja edustaa aluetasapainotettuja monitasoisia analyysituloksia Spatial survival analysis tarjoaa spatsurv-Bayesian päättely parametristen suhteellisten vaarojen osalta Spatiaaliset selviytymismallit - ja spBayesSurv - Bayesian mallintaminen ja spatiaalisesti vastaavan selviytymisdatan analyysi - paketit spselect-paketti tarjoaa mallintamisfunktioita, jotka perustuvat eteenpäin portaittaiseen regressioon, inkrementaaliseen eteenpäin suuntautuvaan regressioon, vähäisimpään kulman regressioon LARS ja lasamalleihin koverajien spatiaalisen asteikon valitsemiseksi regressiomalleissa. Paikallinen regressio Toimintovalinta spatiaaliseen regressioon riippuu käytettävissä olevasta tuesta. Jos tiedoille on ominaista pistetuki ja tilaprosessi on jatkuva, voidaan käyttää geostatistisia menetelmiä tai funktioita nlme-pakettiin. Jos tuki on alue, ja tilaprosessia ei käsitellä jatkuvana, spdep-pakettiin sisältyviä toimintoja voidaan käyttää. Tämä paketti voidaan nähdä myös tarjoamaan tilakontronometrisiä funktioita, ja kuten yllä on mainittu, saadaan perustoiminnot naapurilistojen ja tilapainojen rakentamiseen , spatiaalisen autokorrelaation testit alueellisiin tietoihin, kuten Moran s I, an d - toiminnot paikkatietojen regressiomallien sovittamiseksi Se tarjoaa täyden valikoiman paikkatietojen paikallisia indikaattoreita, kuten paikallista Moran s I: tä ja diagnostisia työkaluja sovitettuja lineaarisia malleja varten, mukaan lukien Lagrange Multiplier - testit Spatiaalinen regressiomallit, jotka voidaan asentaa maksimaalisen todennäköisyyden mukaan, ovat spatiaalinen lag mallit, spatiaaliset virhemallit ja spatiaaliset Durbin-mallit Suurimpiin datajoukkoihin voidaan käyttää vähäisiä matriisimetekniikoita maksimaalisen todennäköisyyden sovittamiseksi, kun taas kahden tilavuuspintaisen pienimmän neliösumman ja yleistetyn hetken estimaattorin menetelmä ovat vaihtoehtoisia. Käytettäessä GMM: tä voidaan käyttää sphet-menetelmää sekä autokorrelaation että heteroskedasticity Spatiaalilukujen regressio saadaan käyttämällä mukautettua MCMC: tä spatcountsilla McSpatial tarjoaa toimintoja paikallisesti painotetulle regressiolle, puoliparametriselle ja ehdollisesti parametriselle regressiolle, Fourier - ja cubic spline - funktioille, GMM: lle ja linearisoidulle spatiaaliselle logiitille ja probitille, k-tiheysfunktioille ja vastafaktuotteille , epäsparametrinen kvantilapaine ioni - ja ehdollisen tiheyden funktiot, Machado-Mata-hajoaminen kvantitatiivisten regressioiden, spatiaalisen AR-mallin, toistuvien myyntimallien ja ehdollisesti parametristen logit - ja probit-ominaisuuksien kanssa. splm-paketti tarjoaa menetelmiä spatiaalisten paneelitietojen sovittamiseksi maksimaalisen todennäköisyyden ja GM: n avulla. Kaksi pientä pakettia S2sls ja spanel tarjota vaihtoehtoisia toteutuksia ilman suurta osaa laitteistoista HSAR-paketti tarjoaa hierarkkisia spatiaalisia autoregressiivisia HSAR-malleja, jotka perustuvat Bayesin Markov-ketjuun Monte Carlo MCMC - algoritmilla spatialprobit mahdollistaa Bayesian estimaatin spatiaalisen autoregressiivisen probit-mallin SAR-probit-mallin avulla ProbitSpatial-paketti tarjoaa menetelmiä sopivia Binomial-avaruudellisia probit - malleja suurempien datajoukkojen joukkoon Spatiaalinen autoregressiivinen SAR ja spatiaalivirhe SEM probit - malleja on mukana Starma-paketti sisältää toiminnot tunnistaa, arvioida ja diagnosoida Avaruus-Time AutoRegressive Moving Average STARMA - malli. Eko-analyysi alueet ja ympäristötiedot. Ne sisältävät ade4: n kokeellisiin ja euklidisiin menetelmiin ympäristötieteissä, adehabitat-pakkausperheen eläinten elinympäristön valintaa varten. adehabitatHR adehabitatHS adehabitatLT ja adehabitatMA, pastörit avaruus-aikasarjan säätelyyn, hajoamiseen ja analysointiin, vegaani koordinointimenetelmille ja muille hyödyllisille toiminnoille yhteisön ja kasvillisuuden ekologeille sekä monille muille toiminnoille muissa mukana olevissa paketeissa Yksi tällainen on tripNestimation, joka perustuu trip ncf: n tarjoamiin luokkiin, on tullut CRANiin hiljattain ja tarjoaa joukon spatiaalisia ei-parametrisia kovarianssitoimintoja rangeMapper on paketti manipuloida lajeja vaihtelevien karttojen laajuutta, lähinnä välineitä biologisen monimuotoisuuden lajien rikkauden tai elämää historiallisten piirteiden kartoittamiseksi helposti. Siplab-paketti on alusta kokeilemalla spatiaalisesti eksplisiittisiä yksilöllisiä kasvillisuuden malleja. ModelMap rakentaa muille paketeille luo malleja alla maantieteelliset GIS-tiedot SpatialPosition laskee paikkatietomallit Stewart-potentiaalit, Reillyn valuma-alueet, Huffin valuma-alueet Watersheds-paketti tarjoaa vedenkeräyksien yhdistämistä ja spatiaalisen valuma-verkon analyysiä. Off-CRAN-paketti - Rcitrus - on kasvitaudin ilmaantuvuuden spatiaalinen analyysi. Geneland-paketti käyttää kenttiä ja RandomFields käyttää sekä maantieteellisiä että geneettisiä tietoja arvioidakseen tietopaketin väestöjen lukumäärää ja hahmottamaan niiden spatiaalisen organisaation. Ngspatial-paketti tarjoaa välineitä paikkatietojen, erityisesti ei-Gaussin alueellisten tietojen, analysointiin. Se tukee harvaan spatiaalista yleinen lineaarinen sekamuoto Hughesin ja Haranin 2013 ja Caragean ja Kaiserin keskitetyn autologisen mallin 2009 Environmetrics-tehtävänäkymä sisältää paljon täydellisempiä tutkimuksia asiaankuuluvista funktioista ja paketeista. CRAN-paketit. Linkitetty linkit. Kustannusetäisyysalueen analyytikko. Tulolähteen tiedot voi olla ominaisuus luokka tai raster. When inpu t lähdedata on rasteri, lähdesolujen joukko koostuu kaikista lähteiden rasterissa olevista soluista, joilla on kelvolliset arvot Solut, joilla on NoData-arvot, eivät sisälly lähdesarjaan. Arvoa 0 pidetään oikeutena lähteenä. Lähdeverkko voi olla helposti kun lähdetiedot ovat ominaisuusluokkaa, lähdealueet muunnetaan sisäisesti rasteriksi ennen analyysin suorittamista. Rasterin resoluutiota voidaan ohjata Output Cell Size - parametrin tai Cell Size - ympäristön avulla Oletuksena , resoluutio määräytyy tulo-ominaisuuden leveyden tai korkeuden pienemmäksi tuloalueiden vertailussa, jaettuna 250: llä. Kun käytät monilähtöominaisuustietoja tulolähteen tietoihin, on huolehdittava siitä, miten tulo cell size is handled when it is coarse, relative to the detail present in the input The internal rasterization process employs the same default Cell assignment type method as the Polygon to Raster t ool, which is CELLCENTER This means that data not located at the center of the cell will not be included in the intermediate rasterized source output, and so will not be represented in the distance calculations For example, if your sources are a series of small polygons, such as building footprints, that are small relative to the output cell size, it is possible that only a few of them will fall under the centers of the output raster cells, seemingly causing most of the others to be lost in the analysis. To avoid this situation, as an intermediate step, you could rasterize the input features directly with the Polygon to Raster tool and set a Priority field and use the resulting output as input to the Distance tool Alternatively, you could select a small enough cell size to capture the appropriate amount of detail from the input features. When the source input is a feature, by default, the first valid available field will be used If no valid fields exist, the ObjectID field for example, O ID or FID, depending on the type of feature input will be used. Cell locations with NoData in the Input cost raster act as barriers in the cost surface tools Any cell location that is assigned NoData on the input cost surface will receive NoData on all output rasters cost distance, allocation, and back link. If the input source data and the cost raster are different extents, the default output extent is the intersection of the two To get a cost distance surface for the entire extent, choose the Union of Inputs option on the output Extent environment settings. If a Mask has been set in the environment, all masked cells will be treated as NoData values. When a mask has been defined in the Raster Analysis window and the cells to be masked will mask a source, the calculations will occur on the remaining source cells The source cells that are masked will not be considered in the computations These cell locations will be assigned NoData on all outputs distance, allocation, and back link rasters. The Maximum distance is specified in the same cost units as those on the cost raster. For the output distance raster, the least-cost distance or minimum accumulative cost distance of a cell to a set of source locations is the lower bound of the least-cost distances from the cell to all source locations. The cost raster cannot contain values of zero since the algorithm is a multiplicative process If your cost raster does contain values of zero, and these values represent areas of lowest cost, change values of zero to a small positive value such as 0 01 before running Cost Distance by first running the Con tool If areas with a value of zero represent areas that should be excluded from the analysis, these values should be turned to NoData before running Cost Distance by first running the Set Null tool.
No comments:
Post a Comment